南宋时期，太医局刊印了一本极为实用的儿科学专著——《小儿卫生总微论方》。《小儿卫生总微论方》中的卫生即保卫其生；总微是总括精微的意思；论方则是论述古今方书极为详尽的意思。
《小儿卫生总微论方》是一本富有传奇色彩的书籍。传说，有一位农民劳作后到一古墓中乘凉，无意中捡到一本书，这是一本治疗儿科疾病的医学书籍，也就是《小儿卫生总微论方》。贡献此书的何大任说：家藏甚久，至今六十余载，不知作者为谁，博加搜访，未尝闻此书之流播也。这更显得《小儿卫生总微论方》神秘异常。
从书中部分引述《圣济经》以及钱乙等小儿方论看，《小儿卫生总微论方》成书年限应晚于《圣济经》，《圣济经》成书于宋徽宗政和八年(1118年)，而《小儿卫生总微论方》大约成书于北宋末年至南宋初年。《小儿卫生总微论方》的作者可能是一位身处乱世、经历坎坷、学识渊博、在民间悬壶济世的儿科学专家。
《小儿卫生总微论方》是南宋以前儿科学专著，共20卷；卷1~3为总论部分，对医生提出正己正物的要求，分别阐述胎儿的禀受、胎疾、初生儿的洗浴、断脐、哺乳、慎护、食忌、脉理，以及五脏主病、发热症治等；卷4~20为各论部分，系统论述小儿多种常见病，儿科四大证(麻、痘、惊、疳)及咳嗽、吐泻、黄疸、诸虫等病尤为详备。此外，《小儿卫生总微论方》还涉及与小儿相关的皮肤科、外科、五官科及扑坠损伤等疾病。《小儿卫生总微论方》引用的文献有《备急千金要方》《小儿药证直诀》《圣济经》等，分门别类，条分缕析，内容丰富，较为全面、系统地论述了小儿生理、病理、诊断、治疗、预防、护理等问题。《小儿卫生总微论方》共载证论108条，方剂约1490首，对病因病机、证候归类、治则方药之论繁而有序，博采众长，所用方药简洁、稳妥、实用，并总结了南宋以前儿科学发展的一些突出成就，汇集了一些新的认识和经验。
科学界定小儿年龄范围
儿童的生理与成人有很大区别，因此，明确儿童的年龄范围就显得非常重要。《黄帝内经》提出18岁以下为小儿；《小品方》提出16岁以下为小儿；《幼幼新书》引用《惠眼观证》的观点，认为15岁以下为小儿；《小儿卫生总微论方》则以性发育成熟为标志，提出14岁以下方为小儿。
《小儿卫生总微论方》记载：男不过十五而娶，至十八已有生一二子者，岂得为小儿也。以今时言之，当以十四以下为小儿治。其十五以上者，天癸已行，婚冠既就，则为大人治耳。《小儿卫生总微论方》根据婚娶生育的实际年龄划分界定小儿年龄，是儿科史上对小儿年龄划分最为合理的说法。
强调按五脏盛怯对小儿生长发育进行调治
《小儿卫生总微论方》认为，母气胎育有盛衰虚实，故子生后有刚柔勇怯之别，怯弱者可用方药补养。心气怯者性痴而迟语，发久不生，生则不黑，用巨胜丹、菖蒲丸补养调治；肝气怯者长不能行而脚细，用麝茸丹、羚羊角丸、赤芝散、乌犀丸补养调治；脾气怯者肌虚而喜汗，汗多则肉瘠，用丁香散、香瓜丸补养调治；肺气怯者肌肤粗败，若无皮而血凝，用龙胆汤补养调治；肾气怯者解颅而囟不合，牙久不生，生则不固，面惨，目睛多白，用玉乳丹补养调治。
总结论述小儿变蒸
小儿变蒸又称变蒸，变是指变其情志、发其聪明，主要是指精神发育；蒸是指蒸其血脉、长其百骸，主要指形体发育。小儿变蒸学说是古代医家用来解释婴幼儿生长发育规律的一种学说，该学说首见于王叔和的《脉经》。
《小儿卫生总微论方》认为，小儿胎化十月而生，皮肤、筋骨、脏腑、气血虽已全具，但未充备，故变蒸者为长神智、坚骨脉之生理现象。谓小蒸10次，每次32天；大蒸4次，每次64天；大小蒸共576天。变蒸结束后，小儿血脉充荣，则手能握，足也能步；气血已荣，脉理已全，方可进行脉诊。
详细阐述小儿三关指纹诊法
由于小儿不会言语，不好切脉，古代中医常凭辨认虎口食指指纹的形与色来诊断疾病，以了解病邪的性质、正气的盛衰、病证的深浅轻重等。《小儿卫生总微论方》记述了11种指纹形态，第一指上仄三节，名曰三关，小儿从男左女右看之，有八般筋脉纹状，以验其病，名曰八片锦。最下一节，名为气关，有纹过者，病才觉重。诸病既生，则气不调顺，故名气关也。第二节名为风关，有纹过者，须发惊风，渐加困重，故名风关也。第三节名为命关，有纹过者，则病极而命危殆，故名命关也……若纹直者是惊，曲者是伤，沉隐为风，曲外有冷，曲内为食。这些方法论述至今为医家沿用。
对小儿疳病论述精微
《小儿卫生总微论方》记载：小儿疳病，诸论丛杂，唯五疳之说为当，其证候外则传变不同，内则悉属五脏。书中详细论述了肝疳、心疳、脾疳、肺疳、肾疳的症状。《小儿卫生总微论方》将小儿疳病与成人劳瘵作了细致的鉴别，指出小儿疳疾，乃与大人劳瘵相似，故亦名疳劳；大人劳者，因肾脏虚损，精髓衰枯；小儿疳者，因脾脏虚损，津液消亡，病久相传，至五脏皆损也；大人劳疾，骨削而气耗；小儿疳疾，腹鼓而神羸，以其病之始也，其脏之传受不同故也。由此可见《小儿卫生总微论方》对小儿疳病论证的精微详备。
对小儿惊痫、疮疹论述详细
小儿惊痫、疮疹是古代儿科常见的急危重症。《小儿卫生总微论方》对此论述尤为详细，认为小儿惊痫宜分轻重，轻者但身热面赤，睡眠不安，悸惕上窜，不发摇者，此名惊也。重者上视身强，手足拳发搐者，此名痫也。治疗时应参推五脏、审别形候、察其虚实、观以时刻进行辨证施治。
《小儿卫生总微论方》论述了小儿疮疹与伤寒的区别，治疗时初宜温平，不若伤寒发散解之；病中切忌大下，热者极盛者微与利之；已出慎不可下；至疮疹焦落，病体已复尚可用解余毒药下之，亦不可快药过多。在治疗中对于疮疹下法论述甚为严谨。
对小儿破伤风见解独到
《小儿卫生总微论方》首次指出小儿脐风撮口与成人破伤风同类，亦如大人因破伤而感风，则牙关噤而口撮，不能入食，身硬，四肢厥逆，与此候颇同，故谓之脐风撮口。在小儿破伤风预防上，《小儿卫生总微论方》提倡用烙脐饼按脐带上，并烧炙脐带，再用封脐散封裹脐部，不但对预防破伤风杆菌感染有重要作用，而且为小儿开辟了新的给药途径。
用发展的眼光看待医学
《小儿卫生总微论方》既记载了当时外科可以治疗的六指、缺唇2种先天性畸形，还记载了双瞽、只眇、独肾、侏儒等当时不能治疗的先天性畸形。作者以发展的眼光看待医学，认为十二病中，惟是二种仅有手段。昔人之不能，而后人得之，千载之后，必有治今人不治之病者。
《小儿卫生总微论方》内容丰富，从出生至儿童，凡与之有关的疾病之病因、证候、治法、方药等，无不一一论及，实为集南宋以前儿科学专著，在儿科临床颇受推崇。《四库全书总目提要》评价《小儿卫生总微论方》为详载各证，悉近时医书所未备，其议论亦笃实明晰，无明以来诸医家党同伐异、自立门户之习，诚保婴之要书也。