【古代炮制方法】唐代有辅料制：取石燕二七枚，和五味炒令熟，以酒一斗浸三日(《食疗》)。宋代有捣、研法：“捣罗为末”、“净洗，刷去泥土，收之。左每日空心取一枚，于坚硬无油瓷器内，以温水磨服之”(《灵苑方》)，“童便三分，磨取自然汁”(《总录》)；火煅法(《总微>；)；火煅醋淬：“火煅醋淬九遍，研”(《总录》)，“火煅，醋淬七遍，捣研水飞令极细”(《局方》)；火煅水淬：烧令通赤，水中淬一两次，捣研，水飞，焙干(《三因》)；火煅酒淬：洗净，烧红酒淬(《扁鹊》)等炮制方法。明、清仍沿用研细生用或火煅或火煅醋淬的炮制方法。
【现代炮制方法】
1、石燕：取原药材，除去杂质，洗净，干燥，碾碎或捣碎。
2、煅石燕：取净石燕，捣碎，置耐火容器内，用武火加热，煅至红透，取出，放冷，研成细粉。
3、醋石燕：取净石燕，置耐火容器内，用武火加热，煅至红透，取出后立即投入醋中，捞出，干燥，研细。石燕每100kg用醋30kg。
【饮片性状】石燕为不规则碎块，表面青灰色至土棕色，具银杏叶般的纹理，质较重而硬，可打碎，断面橙黄色或灰色，较粗糙。气无，味淡。煅石燕呈青灰色至灰棕色细粉，外表性状无明显变化。醋石燕为灰褐色细粉，质疏松，具醋气。
【炮制目的】石燕性味咸、凉。归肾经、膀胱经。具有清湿热、利小便、退目翳的功能，用于淋病，小便不通，带下，尿血，肠风痔漏，眼目障翳。煅淬后使药物酥脆，便于粉碎，利于有效成分的煎出。
【应用选择】
1、淋病石燕(研细)配伍瞿麦、滑石、木通、海蛤等，能增强清湿热，利尿功能，可用于小便淋涩痛闷，如石燕丸(《圣惠方》)。亦有石燕烧赤醋淬用，如石燕丹(《幼幼新书》)。配伍赤小豆、商陆子、红蓝花，为细末，葱白汤调服治血淋心烦，尿道涩痛，如石燕散(《圣惠方》)。
2、赤白带下石燕一枚，磨水服，治赤白带下，多年不止(《徐氏家传方》)。
3、肠风痔漏石燕不拘多少(洗净)，每日取1枚，温水磨服。若欲作散，须研细，水飞过取白汁如米泔者。澄，去水，晒干。每日服1.5～3g，清饭饮调下，温水亦得，治久患肠风痔漏，一、二十年不愈，面色萎黄，饮食无味；脏腑伤积泄泻，暑月常泻不止，赤白带下，多年不愈(《灵苑方》)。
4、外障诸翳配伍炉甘石(黄连、归身、木贼、羌活、麻黄煎汁制)、琥珀、朱砂(水飞)、冰片、麝香，研极细末，每用少许点大眦，治外障诸翳，枯涩无泪加熊胆，白翳加阿魏，如石燕丹(《张氏医通》)。
5、拳毛倒睫将倒睫毛拔去，以石燕磨水点毛囊处。或以黄连煎水洗眼后，拔睫，再点(《常见病验方研究参考资料》)。
【现代研究】石燕壳质除含碳酸钙外或有几丁质、磷灰石质；壳内或为白云石质(镁质)方解石。煅石燕，在主要矿物组分、粒度与结构特点上与生石燕相同。X射线衍射曲线证明，生、煅石燕主要矿物组分均为方解石。生样与煅样的热分析曲线特点稍有不同：煅石燕的热分析曲线吸热915℃。比生样948℃有所下移，但始失重690℃(生样650℃)却有所上移，是由共存矿物量比不同引起的。煅样中黏土矿物量&le；5%。煅制过程晶粒间(方解石、黏土矿物间)、晶粒内(方解石解理间)崩解引致方解石个体碎裂，裂隙度增加、自由表面增大使方解石较易受热分解。但煅制时部分黏土质已转化为无水化合物或其几丁质已转化，以致始失重点比生样上移，且失重量降低。石燕化学性质与其矿物组分和矿物结晶粒度有关。从煅样分析结果可知，与药材方解石的组成矿物相比，含更多黏土质，但是石燕的基本矿物组分是方解石，共存黏土质较方解石虽多，石燕的可溶性与方解石可类比。至于石燕煅用，在入汤剂时，水溶率(近3%)大于生样(0.17%)，原因在于煅方解石组分与黏土组分分离的更充分，黏土质成分更易溶出或分散而进入溶液。石燕中微量元素的量及溶出情况不同于方解石，与化石埋藏和化石条件有关，而且随当时地质条件不同，不属同一层的石燕成分也各不相同，溶出情况也有变化。
石燕炮制后水煎液中钙浓度为1.375mg/ml，是炮制前的25倍。证明石燕火煅醋淬后增加了水煎液中钙的浓度。因为石燕主含碳酸钙(石灰石)醋淬的作用可能形成易溶于水的醋酸钙。另外醋淬使石燕质地疏松，所含成分易于溶出，从而增加了钙的煎出量。
石燕钙煎出量与炮制方法有关，实验结果表明：生品<；煅品<；生醋煮品<；煅醋淬品<；煅醋煮品，这表明醋制有助于钙的煎出。煅淬法其钙煎出量因受煅淬的影响，故低于煅醋煮法，同时由于所用药材及醋损耗大，工艺条件难于控制。
【总结】石燕始载于《唐本草》，由于药源等种种原因，近代用量减少。石燕的主要功效是清热、利湿，与方解石的疗效有相似之处，其活性物质可能与所含的主要成分钙和微量成分磷、钾、钠及微量的有机成分有关，因此，考察加工炮制、临床疗效时应考虑到上述因素。煅制时由于加热，几丁质等有机成分将会转化。火煅醋淬，有利于钙的溶出。水飞可除去一部分沾附的黏土，亦会引起某些微量元素量比的变化。石燕传统应用上生品与煅制品无明显的差别。但上述的改变是否影响临床疗效的改变尚待进一步研究。