宿根外黄内却黑，腹中腐烂更奇绝。
泻火祛淋治痈肿，止血安胎除诸热。
一药协耦行四径，独味治疾亦千百。
如鼓应桴善肯萦，医中之妙要承接。
苦芩竟救一巨人，本草纲目世人得。
【药用逸事】
明代李时珍《本草纲目》回忆说：他在26岁时，感冒咳嗽，久咳不止，发热，火燎皮肤，痰每日碗许，口渴多饮，寝食几疲。其父是当时名医李言闻，用柴胡、荆芥、竹沥、麦冬之类均无效，病逐日加剧。家人及邻居认为必死无疑。李言闻查遍医书，偶然发现金元时期名医李东垣治肺病如火燎的论述，恍然大悟，原来烦躁引饮而盛者属气分之热，宜一味黄芩汤以泻肺气分之火。遂取黄芩片一两，水两钟，煎成一钟，给李时珍服。次日即身热尽退，痰咳皆愈。事后，李时珍颇有感叹：“药中肯綮，如鼓应桴，医中之妙，有如此哉!”据分析，李时珍所患可能是大叶性肺炎、肺脓疡之类，属中医肺热实火之证。因黄芩苦寒，以泻实火除肺热见长，从而挽救了这位大药物学家，才使《本草纲目》能问世，而造福人类。
《本草纲目》记载两个案例：“昔有人素来多酒欲，病小腹绞痛不可忍，小便如淋，诸药不效，偶用黄芩、木通、甘草三味煎服遂止。有人因虚服附子药多，大便秘，服黄芩、黄连药而愈。此皆热厥之症也。”
孙思邈《千金方》也有只用一味黄芩煎服，“治淋，亦主下血”。宋代《太平圣惠方》中有黄芩散，即用一味黄芩为末调服，“治吐血、衄血或发或止，皆心脏积热所致”。许叔徵《普济本事方》，也单用一味黄芩为细末，治“崩中下血”。元代朱丹溪有一名方清金丸，以黄芩为末蜜丸，“泻肺火，降隔上热痰”。《兰室秘藏》中的小清空膏，以黄芩为末茶调服，“治少阳头痛及太阳头痛，不拘偏正”。《瑞竹堂经验放方》的芩心丸，独以黄芩新枝者二两为末泛丸，“治妇人四十九以后天癸却行，或多不止”。《本经逢原》中还说：“古方有一味子芩丸，治女人血热，经水暴下不止者，最效。”《本草正》进一步指出：“枯者清上焦之火，尤祛肌表之热，故治斑疹。”所有这些，均是黄芩去诸热之功。
关于黄芩配伍，清代邹澍对张仲景用黄芩总结“仲景用黄芩有三耦”，其一，气分热结者与柴胡为耦，如大柴胡汤、小柴胡汤、柴胡桂枝汤；其二，血分热结者与芍药为耦，如黄芩汤、黄连阿胶汤；其三，湿热中阻者与黄连为耦，如半夏泻心汤、甘草泻心汤、黄芩黄连汤。黄芩协柴胡清气分之热，协芍药泄迫血之热，协黄连解热生之湿。《本草图经》云：“张仲景治伤寒心下痞满、泻心汤四方皆用黄芩，以其主诸热利小肠故也。”金代张洁古用黄芩配白芷“治眉眶作痛”。李时珍、李士材体会，黄芩得酒上行，得猪胆汁清肝胆火，得柴胡退寒热，得芍药治下痢，得桑白皮泻肺火，得白术安胎。
古医家认为，黄芩中枯者为枯芩，细条者为条芩，枯芩体轻主浮，专泻肺、胃、上焦之火；条芩体重主降，专泻大肠、下焦之火。故黄芩主治不外清肺、大肠、胆三经之火，枯芩走肺，重在清肺火；子芩走大肠，重在清大肠之火。
焦树得说：黄芩酒炒偏于泻肺火，治上卫湿热；黄芩炭可用于各种热性出血；枯芩(又名片)偏于清肺胃之火，清肌表之火；条芩(又名子芩)偏于清肠胃之火，并常用于清热安胎。元代朱丹溪云：“黄芩、白术乃安胎圣，俗以黄芩为寒而不敢用，盖不知胎孕宜清热凉血，血不行乃能养胎。”
《丹溪纂要》中有一方叫三补丸，仅黄芩、黄连、黄柏三味苦寒之药，“治上焦积热，泻五脏之火”。
《千金方》中的加减三黄丸，系用黄芩、黄连、大黄三药，据四季调整剂量，竞能治男子五劳七伤、消渴不生肌肉、妇人带下、手足寒热，泻五脏火，以通为补。