【古代炮制方法】唐代有熬制(《千金翼》)。宋代有无灰好酒煮制(《活人书》)，好酒浸制(《洪氏》)，酒洗(《妇人》)，酒洗炒(《扁鹊》)，生姜炒(《旅舍》)，蜜浸一宿炙令香熟、烧焦制炭(《史载》)，米泔浸制(《药证》)，麸炒焦黄色、同吴茱萸共炒制(《总录》)，同巴豆共煮制(《总微》)，酒煮时要求用银器(《三因》)。元代增加了酒蒸、陈壁土炒制(《丹溪》)，童便浸制(《原机》)，姜汁拌炒(《世医》)。明代新增了吴茱萸煎汤炒(《保元》)，朴硝炒制、干漆炒制、猪胆汁炒、入乳炒制、酽醋制、盐汤制(《蒙筌》)，吴茱萸合益智仁共炒制(《医学》)，冬瓜汁浸制七次(《普济方》)，酒洗后再与吴茱萸共炒制(《回春》)，用湿槐花拌炒、牛胆汁浸制(《景岳》)。清代有入猪大肠中煮熟用(《说约》)，黄土、姜汁、酒和蜜四制黄连(《本草汇》)。此时，其炮制方法已达24种。
【现代炮制方法】
1.黄连：取原药材，除去杂质，抢水洗净，润透，切薄片，晾干。或用时捣碎。
2.酒黄连：取黄连片，用黄酒拌匀，闷润至酒被吸尽，置炒药锅内，用文火加热，炒干，取出放凉。黄连片每100千克用黄酒12.5千克。
3.姜黄连：取黄连片，用姜汁拌匀，闷润至姜汁被吸尽，置炒药锅内，用文火加热，炒干，取出放凉。黄连片每100千克，用生姜12.5千克捣汁或干姜4千克煎汁。
4.萸黄连：取净吴茱萸，加水适量，煎煮半小时，去渣取汁拌入黄连片中，闷润至吴茱萸汁被吸尽，置炒药锅内，用文火加热，炒干，取出放凉。黄连片每100千克用吴茱萸10千克。
【饮片性状】黄连为不规则薄片，直径3～8毫米，表面皮部棕色至黯棕色，木部金黄色或橙黄色，可见放射状纹理，髓部红棕色，有时中空；周边黯黄色，粗糙，有细小须根，质坚脆，气微，味极苦。酒黄连，形如黄连片，表面木部棕黄色，偶见焦斑，周边棕褐色，具炒香气而略带酒香。姜黄连形如黄连片，表面木部棕黄色，周边棕色，有姜的辛辣味。萸黄连形如黄连片，表面木部棕黄色，周边棕色，有吴茱萸的辛辣味。
【质量标准】黄连水分不得过14.0%，总灰分不得过5.0%，稀醇浸出物不得少于15.0%。味连以盐酸小檗碱计，含小檗碱不得少于5.5%，表小檗碱不得少于0.80%，黄连碱不得少于1.6%，巴马汀不得少于1.5%。
黄连饮片水分不得过12.0%，总灰分不得过3.5%，以盐酸小檗碱计，含小檗碱不得少于5.0%，含表小檗碱、黄连碱和巴马汀的总量不得少于3.3%。酒黄连、姜黄连、萸黄连要求同黄连片。
【炮制目的】黄连味苦，性寒。归心经、脾经、胃经、肝经、胆经、大肠经。具清热燥湿、泻火解毒之功能。
生黄连苦寒之性颇盛，善清心火，解毒，多用于心火亢盛，烦躁不眠，神昏谵语，以及湿热诸证如湿温、痢疾、热毒疮疡等。酒黄连能借酒力引药上行，缓其寒性，善清头目之火，多用于肝火偏旺，目赤肿疼。姜黄连能缓和过于苦寒之性，并增强其止呕作用，善清胃热呕吐。萸黄连抑制其苦寒之性，使黄连寒而不滞，以清气分湿热，散肝胆郁火，多用于肝气犯胃，呕吐吞酸等。
【应用选择】
1、生用
(1)热病神昏：常与栀子、黄芩等同用，能清热泻火解毒，可以治湿热病，心火炽盛，高热心烦，甚则神昏谵语者，如黄连解毒汤(《外台》)。
(2)杂病心火偏亢：常与栀子、莲心等同用，能增强泻心火的功能，可治心火偏亢所致的心烦失眠，口舌生疮等症；若心火内炽迫血妄行者，常配伍大黄、黄芩等，能泻火止血，用于火热迫血妄行之吐血、衄血，如泻心汤(《金匮》)。
(3)湿温病：常与厚朴等同用，能清热化湿，可治湿温病，发热不退，胸脘痞闷，恶心呕吐，舌苔黄腻者。
(4)泄泻：常与黄芩、葛根、甘草同用，能清大肠湿热，可治湿热泄泻，发热、口渴，泻下急迫，粪色黄褐而臭，肛门灼热者。
(5)痢疾：常与木香或白头翁、秦皮等同用，能清热止痢，治湿热痢疾，腹痛，里急后重，肛门灼热等，如香连丸或白头翁汤(《伤寒论》)。
(6)热毒疮疡：常与黄芩、连翘等同用，能增强清热解毒作用，可治热毒疮疡，红热肿痛者。若为耳目肿痛，可用本品研末外用或浸汁涂患处。
(7)消渴症：常与天花粉、生地等同用，能清泻胃热，生津止渴，可治胃火炽盛，消谷善饥，烦渴多饮之中消证。
2.制用
(1)肝火偏旺：酒黄连，常配伍龙胆草、黄芩等，能泻肝火明目，治肝火偏旺，目赤肿痛等。亦可单用本品煎汁点眼。
(2)胃热呕吐：姜黄连，常与苏叶、半夏等同用，能清胃止呕，可治胃热呕吐，舌苔黄腻者。
(3)肝郁犯胃：萸黄连.常与淡吴茱萸、姜半夏、竹茹等同用，能清热疏肝和胃，可治肝郁犯胃，胃失和降而致的呕吐吞酸，干呕泛恶，脘胁胀痛，烦闷不舒等症，如左金丸(《丹溪》)。
【现代研究】黄连中主含小檗碱(又叫黄连素)，含量高达5%～8%。小檗碱有明显抗菌作用，且抗菌范围广，对多种G+、G-菌有抑制作用，其中对痢疾杆菌、结核杆菌、金黄色葡萄球菌的抗菌作用最强，对钩端螺旋体及多种致病性真菌，如红色毛癣菌、石膏样毛癣菌也有抑制效果，对流感病毒也有明显的效果。
现代研究表明，经炮制，其主成分小檗碱因受热程度不同，而有不同程度的破坏。小檗碱含量生黄连最高，约7.1%；炒黄连次之，约6%～9%；焦黄连再次，约3.3%；黄连炭最少，约2.9%。在试管中抗菌作用亦随其小檗碱的含量减低而减弱。有人研究了黄连生品和酒制品中小檗碱的含量，结果生黄连为5.90%，而酒黄连为5.84%，呈减少趋势；但它们的溶出率却是生黄连为58.17%，酒黄连为90.97%。说明酒黄连虽然含量下降，但溶出率显著增高，相应地增强了疗效。不同地区(江西、天津、上海等)炮制的黄连饮片及其原生药中总生物碱和小檗碱的含量均较接近，其中总生物碱的含量范围在10.29%～13.33%之间，小檗碱的含量范围在5.863%～8.622%之间，小檗碱占总生物碱的比例范围均在55%～67%内。这一研究结果说明黄连在炮制成饮片过程中，小檗碱与总生物碱流失呈一定比例。从薄层扫描法测定的黄连及其炮制品中5种生物碱含量结果来看，生黄连、白酒制黄连、黄酒制黄连、姜制黄连、吴茱萸制黄连中，黄连碱的百分含量(%)分别为3.27、3.19、3.20、2.94、2.68，甲基黄连碱的百分含量(%)分别为2.78、2.29、2.34、2.44、2.32，小檗碱的百分含量(%)分别为7.79、6.91、7.47、7.70、6.12，巴马亭的百分含量(%)分别为3.21、2.72、2.79、2.74、2.69，药根碱的百分含量(%)分别为2.51、2.31、2.45、2.33、2.34。由此研究结果可知，黄连生品中5种生物碱含量较其不同炮制品高，这表明炮制对其有所影响；黄连炮制后这5种生物碱的含量差异不大，它提示根据中医药理论及辨证施治法则，选用不同炮制品的黄连配伍处方入药，为不同的制剂及临床用药提供了依据。通过用原子吸收分光光度计对四川产的石柱黄连及其炮制品(生黄连、白酒制黄连、黄酒制黄连、姜制黄连、吴茱萸制黄连)中Cu、Mn、Fe、Zn、K、Ca、Mg、Sr等8种元素的分析研究，结果表明有5种人体必需的微量元素Cu、Zn、Mn、Fe、Sr存在，而不同炮制品水煎液中K、Ca、Mg等3种元素均高于生黄连。实验结果还表明，白酒制品、黄酒制品的Mn、Zn、Ca等元素煎出率高于生品，这说明炮制对其有一定作用，酒制可增强药物溶出度。在定量分析中，发现煎煮时间对黄连中主要成分小檗碱、巴马汀的溶出率有较大的影响，开始随时间延长而增高，当煮1小时，随时间延长而下降，故在煮时注意时间长短。从雅连、味连、云连及其酒制品、吴茱萸制品的薄层层析和紫外吸收光谱的对比试验结果表明，它们层析图谱一致，紫外吸收光谱图形相似，最大吸收波长和最小吸收波长相同。主要成分小檗碱、巴马汀、药根碱都存在，炮制前后化学成分无明显变化。从雅连、云连、味连及其酒制品、姜制品、吴茱萸制品总生碱含量，同一样品炮制前后总生物含量无明显差异。另有实验表明黄连在炮制过程中含量降低，导致黄连有效成分含量降低的主要因素是水浸流失。
黄连及其炮制品的体外抗菌研究结果表明，生黄连经酒、姜、吴茱萸炮制后的酒黄连、姜黄连和萸黄连仍有不同的抗菌活性，且均出现了炮制前未有的对绿脓杆菌的抑制作用。黄连经姜制后对变形杆菌的抑制作用增强，并优于其他炮制品。利用微量热法，测定大肠杆菌在黄连不同炮制品总生物碱作用下的生长热谱曲线，结果，黄连不同炮制品总生物碱均能不同程度地抑制大肠杆菌的生长，偏温性药姜制黄连、酒制黄连、吴茱萸黄连使大肠杆菌指数生长期的生长速率常数显著减小，生长代谢过程中热量释放显著增加。偏寒性药生黄连、醋制黄连、胆汁黄连也使生长速率常数减少，却使热量释放略增加，两者存在较稳定的差异。
据实验，黄连润制切片质量与季节有关，水温高小檗碱损失多，水温低小檗碱损失少，故建议饮片生产尽可能按排在春、冬季节水温较低的时候进行。酒炒黄连的火候在实际操作中较难控制，通过多年的生产实践体会到以火头短促有力，火苗不着锅底的弱火炒制酒黄连，可以有效地防止黄连的焦化问题。操作时，将黄连片用酒(8:1)闷润，置铁锅中，不断翻铲至干，由表面金黄色转呈深黄为度。这样既能最大限度地保存小檗碱成分，又可防止酒的有效成分大量挥发，并且继承了传统的炮制方法。
不同干燥方法对黄连中小檗碱含量亦有影响。盐酸小檗碱的含量依次为；阳光下用薄纸遮盖干燥>；烘箱干燥>微火炒干>阳光直射干燥。饮片外观色泽，以太阳光下用薄纸遮盖干燥为最好，烘箱60℃干燥与其基本相近，太阳光直射干燥的颜色较上述两法明显变深，微火烘干的颜色最次，说明传统的薄纸遮盖晒的方法是科学的。纸盖晒干不大适合生产，烘干比薄纸盖晒含量仅低0.05%，并具有保证外观色泽及内在质量、效率高、操作简便等优点。
采用HPlC法测定了酒制黄连等6种不同黄连炮制品样品，运用样品聚类与指纹图谱相似度评价方法分析其结果：黄连不同炮制品的HPLC指纹图谱共有峰特征明显，不同炮制品指纹图谱有差异。样品聚类将黄连不同炮制品分为两类，盐制、醋制、胆汁制黄连为一类，姜制、酒制、吴茱萸制黄连为一类。黄连不同炮制品的指纹图谱主要峰群的整体图貌基本一致，且各炮制品之间的相似度均大于90%。盐酸小檗碱、盐酸巴马汀、盐酸药根碱三种生物碱总量依次为：酒黄连>醋黄连>姜黄连>萸黄连>盐制黄连>胆汁黄连>生黄连。比较不同方法制备的黄连炮制品中小檗碱的含量，依次为：微波法>烘法>煮法>炙法。
【附】
1.近代炮制方法还有炒黄、土炒、炒炭、醋炙、盐水炙、猪胆汁炙等。
2.文献摘录黄连凡使，以布拭上肉毛，然后用浆水浸二伏时，漉出，于柳木火焙干用。(《雷公》)黄连入手少阴心经，为治火之主药。治本脏之火，则生用之；治肝胆之实火，则以猪胆汁浸炒；治肝胆之虚火，则以醋浸炒；治上焦之火，则以酒炒；治中焦之火，则以姜汁炒；治下焦之火，则以盐水或朴消研细调水和炒；治气分湿热之火，则以茱萸汤浸炒；治血分块中伏火，则以干漆末调水炒；治食积之火，则以黄土研细调水和炒。诸法不独为之引导，盖辛热能制其苦寒，咸寒能制其燥性，在用者详酌之。(《纲目》)
【总结】黄连炮制最早见于梁代：除根毛，去须及去皮。炒制始见于唐代，见文献记载炮制品达24种之多。不论在辅料的选用，炮制工艺的改进，还是炮制品质量要求方面，历代都有发展。如宋代的米泔水炙法至明代多以黄土炒代替，以增强止泻作用，并以姜炙法以增强止呕作用。童便炙原是治下焦之火，后来被盐水炙及朴硝炒所代替。其炮制目的是改变药性降低副作用。黄连炮制品在中医临床辨证灵活组方上发挥着不同的治疗作用，如生用清心火，治热痢；炒制后或减低苦寒之性，或用于止血；土炒健脾；酒炙清上焦之火；姜炙清胃热止呕；吴茱萸制多用于吞酸、胁痛等。各取所需，灵活运用，扩大了治疗范围，并从临床中得到验证。近代黄连的炮制方法继承了古代传统的主要方法，其中生黄连、酒黄连、姜黄连、吴萸黄连为《中国药典》所收载。