【古代炮制方法】南北朝刘宋时代有糯米炒和盐汤煮(《雷公》)的方法。宋代有“微炒黄”(《圣惠方》)和糯米炒(《局方》)等法。炒法一直沿用至今。明代又有盐炒(《医学》)的方法。清代增加了土炒(《本草述》)、姜汁拌炒(《逢原》)、拌水蒸透(《拾遗》)等炮制方法。对炮制目的也有记述。
【现代炮制方法】
1、薏苡仁：取原药材，除去皮壳及杂质，筛去灰屑。
2、炒苡仁：取净薏苡仁，置炒制容器内，用文火加热，炒至表面微黄色，略鼓起，取出晾凉。
3、麸炒苡仁：取麸皮撒入热锅内，用中火加热至冒烟时，投入净苡仁，炒至表面黄色，微鼓起，取出，筛去麸皮，晾凉。薏苡仁每100kg用麸皮10kg。
【饮片性状】薏苡仁呈宽卵圆形或长椭圆形，长4～8mm，宽3～6mm；表面乳白色，光滑，偶有残存的黄褐色种皮；一端钝圆，另一端较宽而微凹，有1个淡棕色种脐；背面圆凸，腹面有1条较宽而深的纵沟；质坚实，断面白色，粉性；气微，味微甜。炒苡仁微鼓起，表面浅黄色。麸炒苡仁微鼓起，表面黄色。
【质量标准】薏苡仁杂质不得过2%，水分不得过15.0%，总灰分不得过3.0%，醇浸出物不得少于5.5%，含甘油三酸酯不得少于0.50%。麸炒薏苡仁水分不得过12.0%，总灰分不得过2.0%，甘油三酸酯不得少于0.40%。
【炮制目的】薏苡仁味甘、淡，性凉。归脾经、胃经、肺经。具有利水渗湿，健脾止泻，清热排脓，除痹的功能。
生品性偏寒凉，长于利水渗湿，清热排脓，除痹。用于小便不利，水肿，肺痈，肠痈，风湿痹痛，筋脉挛急及湿温病在气分。炒苡仁和麸炒苡仁性偏平和，二者功效相似，长于健脾止泻，只是炒苡仁渗湿作用稍强，麸炒苡仁健脾作用略胜，常用于脾虚泄泻。
【应用选择】
1、生用
(1)水肿：本品利湿作用较弱，宜于轻症水肿，尤其适用脚气水肿。常与冬瓜皮、泽泻、茯苓、赤小豆等同用，可增强利水消肿作用，治水湿内停，小便不利，肢体水肿。《独行方》用郁李仁煮薏苡仁饭，治水肿喘急。若偏于肾阳虚者，可与杜仲、黄芪、狗脊、菟丝子等同用，有补肾益脾，祛湿消肿的功效，如薏苡杜仲汤(《中药临床应用》)。
(2)痹证：本品能除湿热，利关节，缓解挛急，对湿滞肌肉、筋脉的痹痛或湿热拘挛均可应用。偏热者，可与络石藤、豨莶草、防己等同用；偏寒者，可与麻黄等同用，如麻杏薏苡甘草汤(《金匮》)，用于风湿病人一身尽疼；湿重者可加苍术、防己。《食疗方》以本品同粳米煮粥食，除风湿疼痛，消水肿。
(3)肺痈：常与苇茎、桃仁、冬瓜子等同用，能清肺祛痰，排脓消痈，用于肺痈胸痛，咳吐腥臭脓痰，如苇茎汤(《千金》)。
(4)肠痈：常与牡丹皮、桃仁、瓜萎等同用，能清热活血，排脓消痈，用于肠痈，腹中疗痛，烦躁不安等，如薏苡仁汤(《准绳》)。若与败酱草、冬瓜仁、丹皮、桃仁、金银花等同用，其清热排脓作用更强，如肠痈方(《中药临床应用》)。
(5)湿温初起：湿温初起，病在气分，湿重热轻，胸脘痞满等，可与厚朴、白蔻、杏仁、滑石等同用，能宣畅气机，清利湿热，用于湿温初起或暑温挟湿，邪在气分，头痛恶寒，身重疼痛，面色淡黄，胸闷不饥，午后身热等，如三仁汤(《条辨》)。
2、制用泄泻：多用于脾虚有湿的泄泻。常与党参、白术、山药、茯苓、砂仁等同用，能益气健脾，渗湿止泻，用于脾胃虚弱，食少腹泻，神疲乏力，面色萎黄等，如参苓白术散。
【现代研究】实验研究不同炮制方法对薏苡仁煎液的影响，结果显示，沉淀物高度、比重及蒸发剩余物数值的大小顺序为：麸薏仁<；炒薏仁<；生薏仁<；爆薏仁。四者旋光性皆为右旋，爆薏仁煎出液与麸薏仁煎出液旋光度相同。
【附】
1、近代的炮制方法还有炒焦、蒸后砂烫、蒸制、土炒等。
2、文献摘录“微炒黄色”(《粹言》)。“微炒用治疝气，引药下行盐水煮，或用壁土炒，治泻痢糯米炒。治肺痈二便生用”(《得配》)。
【总结】薏苡仁的炮制记载虽然较早，但方法都较简单，其中炒法历代都用，至今仍是主要炮制方法。出现最早的糯米炒、盐制以及清代出现的土炒，近代个别地区也保留了下来，但现在已不常用。麸炒法虽然是近代才出现的炮制方法，但现已成为《中国药典》的法定方法。
在临床上，薏苡仁以生用为主，炒制品仅用于健脾。由于本品作用较弱，故用量宜较大，否则效果不明显。薏苡仁虽然作用缓和，但用于痹病效果甚好，尤其是下肢疼痛，麻木拘急，与防己、木瓜、蚕沙、白芍、甘草同用，效果良好，兼有热象者更为适宜。