【古代炮制方法】汉代有熬制(《玉函》)法。南北朝刘宋时代有煅法(《雷公》)。唐代提出炙制(《食疗》)、熬令黄色(《千金》)的炮制方法。宋代有火烧通赤(《圣惠方》)、煨制(《史载》)、炒制(《总病论》)、童便煅(《妇人》)、醋煅(《普本》)、韭菜叶和泥煅水飞(《朱氏》等制法。明代主要沿用宋代的方法，但亦有生用(《普济方》)。清代增加了醋煮(《要旨》)、酒煅(《增广》)的炮制方法。
【现代炮制方法】
1、牡蛎：取原药材，除去杂质及附着物，洗净，干燥，碾碎。
2、煅牡蛎：取净牡蛎，置无烟炉火上或适宜的容器中，用武火加热，煅至酥脆时取出，放凉，碾碎。
【饮片性状】牡蛎为不规则的碎块，表面淡紫色、灰白色、黄色或黄褐色，内面瓷白色；质硬，断面层状或层纹状排列，洁白；气微腥，味微咸。煅牡蛎呈不规则片块状，大小不一，灰白色或青灰色，质酥脆。
【质量标准】牡蛎含碳酸钙不得少于94.0%。
【炮制目的】牡蛎味咸，性微寒。归肝经、胆经、肾经。具有重镇安神，潜阳补阴，软坚散结，收敛固涩的功能。
生牡蛎重镇安神，潜阳补阴，软坚散结，用于惊悸失眠，眩晕耳鸣，瘰疬痰核，瘕瘕痞块。煅后质地酥脆，便于粉碎和煎出药效，增强了收敛固涩的作用。用于自汗，盗汗，遗精崩带，胃痛吐酸。
【应用选择】
1、生用
(1)眩晕耳鸣：常与赭石、生龟板、白芍、生龙骨等同用，能增强平肝潜阳的作用。用于肝阳上亢，头目眩晕，或有耳中蝉鸣，阳气浮越，精神不安，如镇肝熄风汤(《参西录》)。
(2)瘰疬、瘿瘤：常与浙贝母、玄参、夏枯草等同用，具有化痰软坚的作用于瘰疬、瘿瘤等，如内消瘰疬丸(《医学心悟》)。与鳖甲，丹参、莪术等配伍，近代常治肝、脾肿大。
2、制用
(1)自汗、盗汗：常与麻黄根、黄芪、浮小麦同用，具有固表敛汗的作用。用于气虚不足，自汗盗汗，体倦神怠，如牡蛎散(《局方》)。
(2)遗精滑泄：常与蒸芡实、莲须、炒沙苑子等同用，具有益肾固精的作用，用于肾虚精关不固，梦遗或滑精，腰脚酸软，如金锁固精丸(《集解》)。
(3)崩中漏下：常与阿胶、赤石脂、当归等同用，具有固经止血的作用，用于冲任不固，崩中漏下，日久不愈者，如牡蛎丸(《准绳》)。
(4)赤白带下：常与山药、龙骨、乌贼骨等同用，具有固涩止带的作用，用于脾胃虚弱，带脉为病，白带绵下，清稀如水液(《参西录》)。
(5)疮疡溃烂：常与黄丹、枯矾研为细末搽之，具有生肌敛疮的作用，用于疮疡溃烂，久不收口，阴部生疮，或湿水痒患，腋汗，手足心汗，如牡蛎散(《准绳》)。
【现代研究】牡蛎含80%～95%的碳酸钙，磷酸钙，并含镁、铝、硅、氧化铁及有机质等，炮制后对其理化性质有一定的影响。
牡蛎经煅后，质地酥脆，易于粉碎，并使一部分钙盐受热分解；变成钙的氧化物，从而增强了制酸及收敛的作用，也有利于有效成分煎出。
实验表明，牡蛎经煅后，铁、锰、锌元素的煎出量较生品显著增加，尤其是锌元素煎出量为生品的7.6倍，如用火煅醋淬法炮制，锌、锰元素的煎出量增加更为明显。牡蛎经炮制后，微量元素的含量都有不同程度的提高，其中K、Al、P较为显著。福建产的长牡蛎经炮制后，Fe的含量煅品要高于生品近5倍。对不同条件下煅牡蛎的外观性状、收得率、锌、总钙含量等进行测定，上海、无锡、西安、南京的煅制品比较接近，外观呈青灰色，质较酥脆，总钙含量均在39.2%以下，表明CaC03成分基本未分解。天津、北京的煅制品呈灰白色，质松脆易碎，总钙量达43%以上，说明CaC03已明显受热分解。据文献报道，牡蛎煅醋淬品水煎液中钙离子含量高于煅品和生品。生品水煎液中蛋白质的含量略高于醋淬和煅品。对兔正常血压煅醋淬品煎剂呈现降低，生品呈现微上升，去钙的煎剂具有明显的升压作用，故认为应以煅醋淬法炮制。
抗溃疡实验表明，在0.6mol/LHC1、无水乙醇或幽门结扎所致大鼠胃溃疡模型上比较了生牡蛎、煅牡蛎1号(900℃，1小时)、煅牡蛎2号(350℃，8小时)的预防作用，结果牡蛎1号工艺煅制后明显提高抗实验性胃溃疡活性。牡蛎煅法炮制费时长，损耗大。用转炉或炒药机炮制，可提高工效，节省燃料，保证质量，减少损耗，以牡蛎煎出液中Ca2+含量为指标，采用正交试验法，得出最佳的工艺条件为：550℃，煅2.5小时，煅后醋淬。
【附】
1、近代炮制方法还有糠煅、煅淬等。
2、文献摘录凡修事，先用二十个，东流水盐一两煮一伏时后，人火中烧令通赤，然后入钵中，研如粉用也(《雷公》)。咸寒入肾，能益阴潜阳，退虚热，软坚痰，煅之则燥而兼涩，又能固下焦，除湿浊，敛虚汗，则咸寒介类之功，有重镇摄下之意(《便读》)。
【总结】牡蛎历代炮制方法很多，并随时代发展，炮制的品种各有特色，在宋代以前多不加辅料制，从宋代起，开始有醋制和童便制，至清代又增加酒制。古人创制许多炮制方法是有一定道理的，如用醋制、酒制与牡蛎的软坚散结有一定协同作用，对于用童便制的机理尚待进一步研究探讨。
现代常用的牡蛎制品有生牡蛎、煅牡蛎两种，《中国药典》和地方规范中均收载这两种炮制的方法。